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Logiciel de facturation électronique pour auto-entrepreneur : comparatif 2026

Depuis le 1^er septembre 2026, tout micro-entrepreneur doit pouvoir recevoir des factures électroniques, et il devra en émettre à partir du 1^er septembre 2027. Bonne nouvelle : plusieurs plateformes agréées sont gratuites. Voici le comparatif des logiciels les plus utilisés par les indépendants, et comment choisir.

Mis à jour le 2 novembre 2026 · Vérifiez les offres sur le site de chaque éditeur, elles changent souvent

En bref

Vous n'avez pas encore choisi de plateforme pour recevoir vos factures ? C'est obligatoire depuis le 1^er septembre 2026 : faites-le maintenant.
Pour une micro-entreprise qui facture peu : Indy, Tiime ou Abby suffisent, gratuitement.
Pour gérer aussi devis, clients, stock et relances dans un même outil : Axonaut.
Vous pouvez utiliser la même plateforme pour recevoir et pour émettre, ou deux différentes.

Le comparatif

Logiciel	Statut	Offre gratuite	Pour qui
Indy	Plateforme agréée (janvier 2026)	Oui, facturation électronique incluse	Micro-entrepreneurs et indépendants qui veulent aussi la compta et un compte pro
Tiime	Plateforme agréée (décembre 2025)	Oui, offre Free	Freelances qui veulent un outil simple, et qui passeront peut-être en société
Abby	Plateforme agréée (janvier 2026)	Oui, offre Basique, e-reporting compris	Micro-entrepreneurs qui veulent aussi suivre leurs déclarations Urssaf
Pennylane	Plateforme agréée	Oui, pour les micro-entreprises sans TVA	Ceux qui travaillent avec un expert-comptable équipé de Pennylane
Axonaut	Plateforme agréée n°0110 (janvier 2026)	Non, essai gratuit	TPE et indépendants qui veulent un outil complet : CRM, devis, factures, relances, trésorerie
Freebe	Solution compatible, reliée à une plateforme agréée	Non, essai gratuit	Freelances du numérique qui suivent leur temps et leur rentabilité par mission

Statuts relevés en novembre 2026 sur les sites des éditeurs. La seule référence officielle est la liste des plateformes agréées publiée sur impots.gouv.fr.

Notre choix selon votre situation

Vous facturez peu, surtout des particuliers

Prenez une plateforme agréée gratuite : Indy, Tiime ou Abby. Elles couvrent la réception de vos factures fournisseurs, l'émission en 2027 et la transmission des données de vos ventes aux particuliers. Choisissez celle dont l'interface vous plaît : vous pourrez changer plus tard.

Vous voulez un seul outil pour toute votre gestion

Axonaut réunit fichier clients, devis, factures, relances, suivi de trésorerie et facturation électronique, avec son propre statut de plateforme agréée. C'est payant, mais ça remplace plusieurs outils. Il y a un essai gratuit : avec notre lien, vous avez 1 mois offert.

Vous avez un expert-comptable

Demandez-lui d'abord quel outil il utilise : s'il travaille sur Pennylane ou un autre logiciel, prendre le même vous fera gagner du temps à chaque clôture. Voir faut-il un expert-comptable ?

Plateforme agréée ou solution compatible ?

Plateforme agréée : immatriculée par l'administration fiscale. Elle envoie vos factures à la plateforme de votre client et transmet les données à l'administration.
Solution compatible : un logiciel qui crée des factures au bon format, mais qui passe par une plateforme agréée partenaire pour les envoyer.

Les deux vous mettent en règle. Avec une solution compatible, vérifiez simplement à quelle plateforme agréée elle est reliée, et si ce raccordement est inclus dans le prix.

Les 5 questions à poser avant de choisir

Est-elle sur la liste officielle des plateformes agréées, ou reliée à une plateforme qui y figure ?
Que contient vraiment l'offre gratuite : nombre de factures, envoi par e-mail, relances, e-reporting ?
Gère-t-elle l'e-reporting de vos ventes aux particuliers ? Indispensable si vous vendez à des particuliers.
Pouvez-vous exporter vos données facilement si vous changez d'outil ?
Correspond-elle à votre façon de travailler : application mobile, devis, acomptes, paiement en ligne ?

Calendrier complet, amendes et cas particuliers : voir notre guide facturation électronique 2026-2027. Et pour les mentions obligatoires : facturation auto-entrepreneur.

Questions fréquentes

Un auto-entrepreneur doit-il avoir un logiciel de facturation électronique ?

Oui, s'il est assujetti à la TVA, même en franchise. Depuis le 1er septembre 2026, il doit pouvoir recevoir des factures électroniques par une plateforme agréée. À partir du 1er septembre 2027, il devra aussi émettre ses factures aux clients professionnels sous ce format, et transmettre les données de ses ventes aux particuliers.

Existe-t-il une plateforme agréée gratuite ?

Oui. Plusieurs plateformes agréées incluent la facturation électronique dans une offre gratuite, notamment Indy, Tiime et Abby. Vérifiez les limites de chaque offre gratuite : certaines fonctions (relances, signature, envoi par e-mail) peuvent être réservées aux offres payantes.

Quelle différence entre plateforme agréée et solution compatible ?

Une plateforme agréée est immatriculée par l'administration fiscale : elle transmet elle-même vos factures et vos données. Une solution compatible est un logiciel qui produit des factures au bon format, mais qui doit passer par une plateforme agréée partenaire pour les envoyer. Les deux permettent d'être en règle.

Comment vérifier qu'un logiciel est bien plateforme agréée ?

La liste officielle des plateformes agréées est publiée et mise à jour sur impots.gouv.fr. Les plateformes agréées peuvent aussi afficher un logo officiel « Plateforme agréée – Facturation électronique ».

TransparenceLes liens Axonaut et Abby sont des liens partenaires : si vous vous abonnez par ce lien, nous touchons une commission, sans surcoût pour vous. Cela ne change pas notre recommandation : pour une micro-entreprise qui facture peu, une plateforme agréée gratuite suffit, et nous citons aussi celles avec qui nous n'avons aucun partenariat.